技術(shù)原理:主要應(yīng)用連接酶檢測(cè)反應(yīng) (ligase detection reaction,LDR)技術(shù)。即在Taq DNA連接酶的作用下, 當(dāng)左右兩條寡核苷酸探針與目的DNA序列完全互補(bǔ),并且兩條探針之間沒有空隙時(shí)才能發(fā)生連接反應(yīng),否則連接反應(yīng)不能進(jìn)行,最后通過(guò)熒光掃描片段長(zhǎng)度,根據(jù)測(cè)序峰移動(dòng)的膠位置,通過(guò)末端未標(biāo)記探針的3個(gè)堿基差異,確定同一位點(diǎn)的不同基因型,再通過(guò)末端未標(biāo)記探針的7個(gè)堿基差異,確定不同位點(diǎn),最終實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP 位點(diǎn)的精確檢測(cè)。
原理及流程示意圖:
PCR-LDR技術(shù)流程:
1. 多重PCR擴(kuò)增:獲得目標(biāo)位點(diǎn)所在的片斷;
2. 多重LDR:得到長(zhǎng)度各異的檢測(cè)產(chǎn)物;
3. 3730測(cè)序儀檢測(cè):根據(jù)測(cè)序電泳得到不同的峰值;
4. 判斷SNPs結(jié)果,數(shù)據(jù)分析;
方法特點(diǎn):
1. 通用性強(qiáng):適用任何多態(tài)性位點(diǎn)和各種SNP位點(diǎn)的分型,不需要人工引入酶切位點(diǎn);
2. 分型準(zhǔn)確,檢出率高:其準(zhǔn)確度可達(dá)99.2%以上。
3. 檢測(cè)快速:LDR技術(shù)的最大優(yōu)點(diǎn)就是實(shí)驗(yàn)時(shí)間短!與Taqman、RFLP、SSCP和DHPLC相比,由于檢測(cè)條件更易控制,從DNA樣本到數(shù)據(jù)的產(chǎn)出,整體實(shí)驗(yàn)只需要幾周。
適宜范圍:適宜 100-1000個(gè)樣品,1-5個(gè)位點(diǎn);
訂單點(diǎn)擊下載:SNP基因分型訂單表
客戶需要提供:
1. 細(xì)胞,組織或血液等樣品材料,基因組DNA提取費(fèi)用單獨(dú)收費(fèi);
2. 基因組DNA(體積≥30μl,濃度≥50 ng/μl),純度 OD260/280 為1.7~1.9之間;
3. 人類基因組需提供SNP位點(diǎn)的RS號(hào)。其它物種如牛、雞、魚等無(wú)rs號(hào)的,需提供SNP位點(diǎn)上下游各200bp的確切序列,SNP位點(diǎn)的突變類型,以及位點(diǎn)的上下游25bp內(nèi)是否存在其它連鎖位點(diǎn)。
最終提交結(jié)果:
1. SNPs結(jié)果(ExceL表格);
2. 完整實(shí)驗(yàn)報(bào)告:擴(kuò)增和反應(yīng)體系、所涉及的引物、探針序列;
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