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      核酸、蛋白質(zhì)的各種換算
      來源:Genenode|君諾德公司     發(fā)布時間:2018-08-18     Hits:44453

      分光光度值與核酸濃度的換算  
      1 A260 unit dsDNA=50 μg/ml  
      1 A260 unit ssDNA=33 μg/ml 
      1 A260 unit ssRNA=40 μg/ml 
        
      蛋白質(zhì)質(zhì)量與摩爾數(shù)的轉(zhuǎn)換 
      100 pmol的100 kDa蛋白分子=10 μg 
      100 pmol的50 kDa蛋白分子=5 μg 
      100 pmol的10 kDa蛋白分子=1 μg 
      100 pmol的1 kDa蛋白分子=100 ng 
        
      DNA分子質(zhì)量與摩爾數(shù) 
      1 μg of 1000 bp DNA = 1.52 pmol(3.03 pmol of ends) 
      1 μg of pBR322 DNA = 0.36 pmol DNA 
      1 pmol of 1000 bp DNA = 0.66 μg 
      1 pmol of pBR322 DNA = 2.8 μg 

      蛋白質(zhì)/DNA之間的轉(zhuǎn)換 
      1 kb的DNA可編碼333個氨基酸=37 kDa的蛋白分子 
      270 bp的DNA= 10 kDa的蛋白分子 
      9個氨基酸=1 kDa的蛋白分子
      810 bp的DNA= 30 kDa的蛋白分子 
      2.7 kb的DNA= 100 kDa的蛋白分子 
        
      DNA分子質(zhì)量與摩爾數(shù)的換算公式 
      對于dsDNA 分子 
      將pmol轉(zhuǎn)換為μg 
      pmol×N×(660 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg 
      將μg轉(zhuǎn)換為pmol 
      μg×(106pg/1 μg)× (pmol/660 pg)×(1/N) = pmol 
      其中 N 是核酸堿基對數(shù),660 pg/pmol 是每對堿基的平均分子量(MW)。 
        
      一個氨基酸的平均分子量=100 Daltons(道爾頓) 
      Daltons(Da) kilo是原子質(zhì)量單位的另一名稱,千道爾頓 
      Dalton (kD)即為1000 道爾頓 。因此,質(zhì)量為46 kD的蛋白質(zhì)是每摩爾分子46000克的分子。 
        
      對于ssDNA 分子 
      將pmol轉(zhuǎn)換為μg 
      pmol×N×(330 pg/pmol)×(1 μg/106pg) = μg 
      將μg 轉(zhuǎn)換為pmol 
      μg×(106pg/1 μg)×(pmol/330 pg)×(1/N) = pmol 
      其中 N 是核酸堿基數(shù),330 pg/pmol 是每個堿基的平均分子量(MW)。



      同位素, 酸、堿, 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)
      (Isotope Data, Acids & Bases, Protein Data)

      同位素數(shù)據(jù)

      同位素

      釋放的微粒

      半衰期

      14C

      b

      5,730 years

      3H

      b

      12.3 years

      125I

      g

      60 days

      32P

      b

      14.3 days

      33P

      b

      25 days

      35S

      b

      87.4 days


      1 Ci

      =

      1,000 mCi

      1 mCi

      =

      1,000 μCi

      1 μCi

      =

      2.2 X 106 disintegrations/minute

      1 Becquerel

      =

      1 disintegration/second

      1 μCii

      =

      3.7 X 104 Becquerels

      1 Becquerel

      =

      2.7 X 10-5 μCi


      酸、堿

      酸或堿

      分子式

      分子量

      比重

      質(zhì)量百分比

      C克分子濃度

      冰醋酸

      CH3COOH

      60.0

      1.05

      99.5

      17.4

      甲酸

      HCOOH

      46.0

      1.20

      90

      23.4

      鹽酸

      HCl

      36.5

      1.18

      36

      11.6

      硝酸

      HNO3

      63.0

      1.42

      71

      16.0

      高氯酸

      HClO4

      100.5

      1.67

      70

      11.6

      磷酸

      H3PO4

      98.0

      1.70

      85

      18.1

      硫酸

      H2SO4

      98.1

      1.84

      96

      18.0

      氫氧化氨

      NH4OH

      35.0

      0.90

      28

      14.8

      氫氧化鉀

      KOH

      56.1

      1.52

      50

      13.5

      氫氧化鈉

      NaOH

      40.0

      1.53

      50

      19.1

      β-巰基乙醇

      HSCH2CH2OH

      78.1

      1.11

      100

      14.3


      蛋白質(zhì)

      菌種: E. coli 或 Salmonella typhimurium 

      細胞

      每個細胞

      每升培養(yǎng)體系(109細胞/ml)

      濕重

      9.5 X 10-13 g

      0.95 g

      干重

      2.8 X 10-13 g

      0.28 g

      總蛋白

      1.55 X 10-13 g

      0.15 g

      體積

      1.15 μm3 = 1 femtoliter

       

      每個細胞中的蛋白濃度: 135 mg/ml

      1升培養(yǎng)體系(109細胞/ml)中所產(chǎn)生的目標蛋白的理論值:
      占總蛋白的0.1%:150 μg/l
      占總蛋白的2.0%:3 mg/l
      占總蛋白的50.0%:75 mg/l


      核苷酸的物理特性
      (Nucleotide Physical properties)

      核苷酸

      分子量

      吸收波長λ max (pH 7.0)

      在λ max 處的吸光度

      ATP

      507.2

      259

      15,400

      CTP

      483.2

      271

      9,000

      GTP

      523.2

      253

      13,700

      UTP

      484.2

      262

      10,000

      dATP

      491.2

      259

      15,200

      dCTP

      467.2

      271

      9,300

      dGTP

      507.2

      253

      13,700

      dTTP

      482.2

      267

      9,600


      核酸數(shù)據(jù)
      (Nucleic Acid Data)

      一個DNA堿基對(鈉鹽)的平均分子量 = 650 道爾頓
      1.0 A260 unit ds DNA = 50 μg/ml = 0.15 mM (in nucleotides)
      1.0 A260 unit ss DNA = 33 μg/ml = 0.10 mM (in nucleotides)
      1.0 A260 unit ss RNA = 40 μg/ml = 0.11 mM (in nucleotides)

      雙鏈DNA分子的分子量(道爾頓) = 堿基對數(shù)目×650
      雙鏈DNA分子的末端摩爾數(shù) = 2 ×DNA質(zhì)量(克)/ DNA分子量(道爾頓)
      限制性內(nèi)切酶酶切后的DNA末端摩爾數(shù): 
      a) 環(huán)狀DNA分子: 2 × DNA摩爾數(shù)× 位點數(shù)
      b) 線性DNA分子: 2 × DNA摩爾數(shù)×位點數(shù) + 2 × DNA摩爾數(shù)

      1 μg 1000 bp DNA = 1.52 pmol = 9.1 × 1011 molecules
      1 μg pUC18/19 DNA (2686 bp) = 0.57 pmol = 3.4 × 1011 molecules
      1 μg pBR322 DNA (4361 bp) = 0.35 pmol = 2.1 × 1011 molecules
      1 μg M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 0.21 pmol = 1.3 × 1011 molecules
      1 μg λDNA (48502 bp) = 0.03 pmol = 1.8 ×1010 molecules

      1 pmol 1000 bp DNA = 0.66 μg
      1 pmol pUC18/19 DNA (2686 bp) = 1.77 μg
      1 pmol pBR322 DNA (4361 bp) = 2.88 μg
      1 pmol M13mp18/19 DNA (7249 bp) = 4.78 μg
      1 pmol λDNA (48502 bp) = 32.01 μg

      1.0 kb DNA = 333個氨基酸的編碼量≈ 37,000 道爾頓蛋白質(zhì)
      10,000道爾頓蛋白質(zhì)≈270 bp DNA
      50,000道爾頓蛋白質(zhì)≈ 1.35 kb DNA


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