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核酸電泳相關(guān)試劑、緩沖液的配制方法
50×TAE Buffer (pH8.5)
□組份濃度 2 MTris-醋酸,100 mMEDTA
□配制量 1 L
□配制方法
1.稱量下列試劑,置于1 L燒杯中。
|
Tris |
242 g |
|
Na2EDTA·2H2O |
37.2 g |
2.向燒杯中加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?
3.加入57.1 ml的乙酸,充分?jǐn)嚢琛?
4.加去離子水將溶液定容至l L后,室溫保存。
10×TBE Buffer (pH8.3)
□組份濃度 890 mMTris-硼酸,20 mMEDTA
□配制量 1 L
□配制方法
1.稱量下列試劑,置于l L燒杯中。
|
Tris |
108 g |
|
Na2EDTA·2H2O |
7.44 g |
|
硼酸 |
55 g |
2.向燒杯中加入約800 ml的去離子水,充分?jǐn)嚢枞芙狻?
3.加去離子水將溶液定容至l L后,室溫保存。
10×MOPS(3-嗎啉基丙磺酸)Buffer
□組份濃度 200 mM MOPS,20 mMNaOAc,10 mMEDTA
□配制量 1 L
□配制方法
1.稱41.8 gMOPS,置于1 L燒杯中。
2.加約700 ml DEPC處理水,攪拌溶解。
3.使用2 N NaOH調(diào)節(jié)pH值至7.0。
4.再向溶液中加入下列試劑。
|
1 MNaOAc(DEPC處理) |
20 ml |
|
0.5 MEDTA(pH8.0)(DEPC處理) |
20 ml |
5.用DEPC處理水將溶液定容至1 L。
6.用0.45 m濾膜過(guò)濾除去雜質(zhì)。
7.室溫避光保存。
注:溶液見(jiàn)光或高溫滅菌后會(huì)變黃。變黃時(shí)也可使用,但變黑時(shí)不要使用。
溴乙錠 (10 mg/ml)
□組份濃度 10 mg/ml溴乙錠
□配制量 100 ml
□配制方法
1.稱量1 g溴乙錠,加入到100 ml容器中。
2.加入去離子水100 ml,充分?jǐn)嚢钄?shù)h完全溶解溴乙錠。
3.將溶液轉(zhuǎn)移至棕色瓶中,室溫避光保存。
4.溴乙錠的工作濃度為0.5 ug/ml。
注意:溴乙錠是一種致癌物質(zhì),必須小心操作。
Agarose凝膠
配制方法
1.配制適量的電泳及制膠用的緩沖液(通常是0.5×TBE或1×TAE)。
2.根椐制膠量及凝膠濃度,準(zhǔn)確稱量瓊脂糖粉,加入適當(dāng)?shù)腻F形瓶中。
3.加入一定量的電泳緩沖液(總液體量不宜超過(guò)錐形瓶的50%容量)。
注:用于電泳的緩沖液和用于制膠的緩沖液必須統(tǒng)一。
4.在錐形瓶的瓶封上保鮮膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波爐中加熱熔化瓊脂糖。加熱過(guò)程中,當(dāng)溶液沸騰后,請(qǐng)戴上防熱手套。小心搖動(dòng)錐形瓶。使瓊脂糖充分均勻熔化。此操作重復(fù)數(shù)次,直至瓊脂糖完全熔化。必須注意,在微波爐中加熱時(shí)間不宜過(guò)長(zhǎng),每次當(dāng)溶液起泡沸騰時(shí)停止加熱,否則會(huì)引起溶液過(guò)熱暴沸,造成瓊脂糖凝膠濃度不準(zhǔn),也會(huì)損壞微波爐。熔化瓊脂糖時(shí),必須保證瓊脂糖充分完全熔化,否則,會(huì)造成電泳圖像模糊不清。
5.使溶液冷卻至60℃左右,如需要可在此時(shí)加入溴乙錠溶液(終濃度0.5 μg/ml)。并充分混勻。
注:溴乙錠是一種致癌物質(zhì)。使用含有溴乙錠的溶液時(shí),請(qǐng)戴好手套。
6.將瓊脂糖溶液倒入制膠模中,然后在適當(dāng)位置處插上梳子。凝膠厚度 一般在3~5 min之間。
7.在室溫下使膠凝固(大約30 min~1 h),然后放置于電泳槽中進(jìn)行電泳。
注:凝膠不立即使用時(shí),請(qǐng)用保鮮膜將凝膠包好后在4℃保存,一般可保存2~5天。
瓊脂糖凝膠濃度與線形DNA的最佳分辨范圍
|
瓊脂糖濃度 |
最佳線形DNA分辨范圍(bp) |
|
0.5% 0.7% 1.0% 1.2% 1.5% 2.0% |
1,000~30,000 800~12,000 500~10,000 400~7,000 200~3,000 50~2,000 |
6× Loading Buffer(DNA電泳用)
□組份濃度
|
30 mM |
EDTA |
|
36%(V/V) |
Glycerol |
|
0.05%(W/V) |
Xylene Cyanol FF |
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0.05%(W/V) |
Bromophenol Blue |
□配制量 500 ml
□配制方法
1.稱量下列試劑,置于500 ml燒杯中。
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EDTA |
4.4g |
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Bromophenol Blue |
250 mg |
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Xylene Cyanol FF |
250 mg |
2.向燒杯中加入約200 ml的去離子水后,加熱攪拌充分溶解。
3.加入180 ml的甘油(Glycerol)后,使用2 N NaOH調(diào)節(jié)pH值至7.0。
4.用去離子水定容至500 ml后,室溫保存。
10 × Loadlng Buffer(RNA電泳用)
□組份濃度
|
10 mM |
EDTA |
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50%(V/V) |
Glycerol |
|
0.25%(W/V) |
Xylene Cyanol FF |
|
0.25%(W/V) |
Bromophenol Blue |
□配制置 10 ml
□配制方法
1.稱量下列試劑,置于10 ml離心管中。
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0.5 MEDTA(pH8.0) |
200 μl |
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Bromophenol Blue |
25 mg |
|
Xylene Cyanol FF |
25 mg |
2.向離心管中加入約4 ml的DEPC處理水后,充分?jǐn)嚢枞芙狻?
3.加入5 ml的甘油(Glycerol)后,充分混勻。
4.用DEPC處理水定容至10 ml后,室溫保存。

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